Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 MAK16-201ENST00000360128 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 USB1-207ENST00000563149 1751 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 ZNF302-203ENST00000457781 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 FSCN3-201ENST00000265825 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 LDLR-207ENST00000558013 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 DSCR3-201ENST00000309117 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 CLDN19-201ENST00000296387 2859 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
CD300CQ08708 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ESYT1-202ENST00000394048 4388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 DGKZ-220ENST00000532868 3118 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
CD300CQ08708 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms