Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC073648.1-201ENST00000508957 930 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 INO80-AS1-202ENST00000560178 444 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC060766.7-201ENST00000587012 1212 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC100843.2-201ENST00000589084 324 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FAM153C-213ENST00000620373 1048 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CACNB1Q02641 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 OR5D14-201ENST00000335605 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC013448.1-201ENST00000422118 808 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LACRT-203ENST00000547511 504 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CACNB1Q02641 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms