Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC11A1P49279 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms