Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPREP23469 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPREP23469 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPREP23469 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPREP23469 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PTPREP23469 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPREP23469 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PTPREP23469 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PTPREP23469 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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