Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1P21675 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1P21675 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1P21675 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms