Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DSEQ9UL01 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms