Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SLC9A4Q6AI14 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SLC9A4Q6AI14 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms