Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COL24A1Q17RW2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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COL24A1Q17RW2 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL24A1Q17RW2 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL24A1Q17RW2 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL24A1Q17RW2 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL24A1Q17RW2 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL24A1Q17RW2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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COL24A1Q17RW2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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COL24A1Q17RW2 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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COL24A1Q17RW2 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
COL24A1Q17RW2 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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