Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
XRCC4Q13426 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
XRCC4Q13426 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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