Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLN3Q13286 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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CLN3Q13286 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLN3Q13286 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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