Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BNIP3Q12983 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BNIP3Q12983 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms