Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FAM27E3Q08E93 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms