Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GGCXP38435 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GGCXP38435 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GGCXP38435 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms