Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AC048380.1-201ENST00000589818 465 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRMP28827 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 LCE4A-201ENST00000335535 388 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRMP28827 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRMP28827 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRMP28827 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRMP28827 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRMP28827 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRMP28827 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRMP28827 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
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PTPRMP28827 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 MBIP-211ENST00000621657 1809 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTPRMP28827 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
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