Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTPRAP18433 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTPRAP18433 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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