Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
HOXB9P17482 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms