Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
XCL2Q9UBD3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms