Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCSER1Q9C0I3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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