Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012158.1-203ENST00000488306 1352 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC239799.2-201ENST00000622359 2002 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009120.6-201ENST00000616116 1460 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01047-201ENST00000415193 778 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENY2-210ENST00000521662 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC027544.1-201ENST00000538408 433 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC051619.5-203ENST00000561404 529 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
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