Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCAPERQ9BY12 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAPERQ9BY12 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms