Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TINF2Q9BSI4 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms