Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
NICN1Q9BSH3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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