Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 DDX27-201ENST00000371764 2643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 MYO9B-201ENST00000397274 7532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 PFDN1-207ENST00000524074 395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC97Q96F63 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms