Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NSMCE1Q8WV22 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms