Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms