Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms