Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VIRMAQ69YN4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VIRMAQ69YN4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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