Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LETM2Q2VYF4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LETM2Q2VYF4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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