Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FSCN1Q16658 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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