Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SCN9AQ15858 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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