Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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SIX1Q15475 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SIX1Q15475 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SIX1Q15475 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SIX1Q15475 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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SIX1Q15475 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
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SIX1Q15475 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SIX1Q15475 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SIX1Q15475 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SIX1Q15475 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SIX1Q15475 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SIX1Q15475 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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SIX1Q15475 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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SIX1Q15475 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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SIX1Q15475 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIX1Q15475 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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SIX1Q15475 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SIX1Q15475 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIX1Q15475 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SIX1Q15475 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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SIX1Q15475 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIX1Q15475 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SIX1Q15475 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIX1Q15475 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SIX1Q15475 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIX1Q15475 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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SIX1Q15475 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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SIX1Q15475 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIX1Q15475 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIX1Q15475 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIX1Q15475 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIX1Q15475 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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