Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IFT88Q13099 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IFT88Q13099 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IFT88Q13099 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms