Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KCNH2Q12809 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms