Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOBRQ0VD83 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms