Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 NBEA-204ENST00000400445 11119 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
IFFO1Q0D2I5 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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