Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PPP3CAQ08209 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms