Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GTF2BQ00403 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms