Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCCD1P59942 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms