Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PEX5P50542 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms