Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC11A1P49279 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms