Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EPHB2P29323 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms