Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PCSK1P29120 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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