Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KDELR1P24390 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KDELR1P24390 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KDELR1P24390 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KDELR1P24390 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KDELR1P24390 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KDELR1P24390 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KDELR1P24390 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KDELR1P24390 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
KDELR1P24390 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
KDELR1P24390 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms