Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SGTAO43765 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGTAO43765 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGTAO43765 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGTAO43765 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGTAO43765 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGTAO43765 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGTAO43765 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SGTAO43765 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGTAO43765 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SGTAO43765 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SGTAO43765 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms