Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf172C9J069 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf172C9J069 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
C9orf172C9J069 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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C9orf172C9J069 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf172C9J069 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf172C9J069 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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