Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NLRP1Q9C000 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms