Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERC6Q8IVU3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERC6Q8IVU3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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