Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPOCD1Q6ZMY3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPOCD1Q6ZMY3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms