Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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