Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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EXT1Q16394 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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EXT1Q16394 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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EXT1Q16394 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
EXT1Q16394 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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